В связи с вступающими с января 2016 года новыми требованиями по охране окружающей среде замеры дымовых газов на каждом из блоков будут производиться отдельно. Для этого необходимо отделить дымовые газы 1, 2 и 7 энергоблоков от дымовых газов 3, 4, 5, 6 и 8 энергоблоков Эстонской электростанции. Переключение будет осуществляться по мере вывода энергоблоков в текущий ремонт.

Согласно директиве по промышленным выбросам, которая вступила в силу в январе 2011 года, начиная с 2016 года, при сжигании топлива в крупных котлах концентрация оксидов серы в дымовых газах не должна превышать уровня 400 мг/Нм3, концентрация оксидов азота - уровня 200 мг/Нм3, уровень содержание пыли – 20 мг/ Нм3.

Новые дымовые трубы будут построены из металла. Высота новых труб составит 95 метров, что значительно меньше нынешних двух бетонных труб электростанции, чья высота составляет 250 метров. На трубах будет установлено оборудование для мониторинга дымовых газов.

Детальная планировка была утверждена в январе 2014 года. Строительство труб осуществляет фирма Eesti Energia Tehnoloogiatööstus AS. Стоимость работ составляте 13,4 млн евро.